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GelRed 核酸染料

發布時間:2016/8/1      點擊次數:3238

產品信息

產品名稱

貨號

規格

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價格(元)

GelRed 核酸染料(500μL in water, 10,000 X)

C1101L1122

500μL

室溫

550

 

GelRed是一種結合于所有dsDNA雙螺旋小溝區域的具有*設計的熒光染料。在游離狀態下,GelRed發出微弱的熒光,但一旦與雙鏈DNA結合后,熒光大大增強。因此,GelRed的熒光信號強度與雙鏈DNA的數量相關,可以根據熒光信號檢測出PCR體系存在的雙鏈DNA數量。GelRed與 EB 有相同的光譜特性,無需改變濾光片及觀察裝置。標準的 EB 濾光片或 SYBR 濾光片都適用,使用與觀察 EB 相同的普通紫外凝膠透射儀觀察即可,在 300 nm 紫外光附近可得到*激發。GelRed的zui大吸收波長約為518 nm,發射波長zui大約為605 nm。GelRed 與雙鏈DNA的親和力非常高,因此可以用做電泳前染色,對分子生物學中常用的酶(如:Taq 酶、逆轉錄酶、內切酶、T4連接酶等)沒有抑制作用。另外,GelRed 與EB相比,誘變能力大大降低。

GelRedzui初由美國Biotium公司研發,艾姆斯試驗表明,這種新型染料細胞透過性、誘變性方面表現優異,得到市場廣泛認可。

運輸與保存方法

常溫運輸、保存,保質期24個月。

使用方法

1.膠染法(用法同EB)

(1)制膠時加入GelRed核酸染料(例如:每50mL瓊脂糖溶液中加入5μL GelRed 10,000×儲液,以此比例類推)。

(2)按照常規方法進行電泳。

注意事項:

此方法染色染料用量相對較少,500 μL染料大約可以做100塊50 mL的膠。

由于GelRed具有良好的熱穩定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉以保證染料充分混勻。也可以選擇將GelRed儲液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中,然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。GelRed兼容所有常用的電泳緩沖溶液。

含有染料的預制凝膠溶液可以大量制備,并長期保存直到使用。

此方法不適合預制聚丙烯酰胺凝膠,對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。

2.泡染法

(1)按照常規方法進行電泳。

(2)用H2O將GelRed 10,000×儲液稀釋約3,300倍到0.1 M NaCl中,制成3×染色液。(例如將15μL GelRed 10,000×儲液和5 mL 1 M NaCl加到45 mL H2O中)。

(3)將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中,緩慢加入足量的3×染色液浸沒凝膠,室溫振蕩染色30 min左右,*染色時間根據凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時間通常介于30 min到1 h,并隨丙烯酰胺含量增加而延長。

注意事項:

1)用泡染法染色時,染料用量較多,單次使用的染色液可重復使用3次左右。3×GelRed染色液可以大量制備,在室溫下避光保存直至用完。

2)如果總是看到條帶彌散或分離不理想,建議使用泡染法染色以確認問題是否與染料有關。

3)如果染色后問題依舊存在,則說明問題與染料無關,請嘗試:降低瓊脂糖濃度、延長凝膠時間以保證邊緣清晰、改進上樣技巧或選擇泡染法染色。

3.預染法(zui省染料的染色方法,按25μL體積上樣,500μL原液理論做20萬個樣品)

1)該方法適用于瓊脂糖凝膠電泳和PAGE凝膠電泳

2)工作液的配制:用電泳緩沖液將10000×的GelRed原液稀釋1000倍,即為10 X GelRed工作液。GelRed工作液可以置2-8℃冷藏一個月以上。

3)制膠:按常規方法制膠,不含任何染料。

4)樣品染色:向分析樣品中加入GelRed工作液和載樣緩沖液,室溫放置10分鐘,使GelRed與樣品中DNA充分結合。GelRed工作液加入量為總上樣量的1/10,使GelRed在上樣時的終濃度為1X.

5)DNA Marker染色:將5μL DNA Marker和1μLGelRed工作液混勻,室溫放置5分鐘,使GelRed與DNA充分結合。

6)上樣、電泳:按常規操作。

注意事項:

根據染料分子量小,帶電荷少的特性開發本染色方法,按照一塊膠10個樣品計算,500μL原液理論上可以完成2萬塊膠的染色。

疑難解答

1. 在常規用酒精沉淀核酸的過程中,GelRed 可以全部從雙鏈核酸上去掉。

2. 如果想對用 GelRed 染過的膠進行 Southern blots,建議在預雜化和雜化溶液中加入 0.1%- 0.3% 的SDS。

3. 在紫外照射透視下,與雙鏈 DNA 接合的 GelRed 呈現紅色熒光。

4. GelRed對玻璃和非聚丙烯材料具有一定親合力。建議在稀釋、貯存、染色等使用過程中用聚丙烯類容器。

5. GelRed原液在室溫保存,如放置冰箱保存會產生部分沉淀,使用前適當加熱并搖勻即可正常使用。

 

幾種核酸染料比較

名稱

靈敏度

穩定性

適用性

安全性

價格

GelRed

通用大小片段電泳染色

美國安全認定無毒

GelGreen

通用大小片段電泳染色

美國安全認定無毒

SYBR Green I

*

100bp以上片段電泳染色

花菁染料,低毒

SYBR Green II

*

單鏈核酸分子電泳染色

花菁染料,低毒

Gold View I

500bp以上片段電泳染色

高毒性,強致癌

EB

100bp以上片段電泳染色

強致癌,強誘變

 


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