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當前位置:首頁 > 技術文章 > arraystar AS-NM-001-1說明書

arraystar AS-NM-001-1說明書

更新時間:2018-08-07      點擊次數:2551

 

Arraystar致力于幫助生物醫學科學研究人員了解監管非編碼RNA(ncRNAs),這已成為21世紀生物醫學研究中吸引力和挑戰性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA,環狀RNA,微小RNA,tRNA,tRF,tiRNA,snoRNA等。自2009年成立以來,我們在ncRNA研究領域的創新產品,深入的實驗專業知識和強大的生物信息學支持了數百種高影響力的出版物。多年來,我們的客戶群已擴展到數千個研究機構。 

超越RNA

隨著新型非編碼RNA的發現及其超出蛋白質編碼轉錄本的調控活性,RNA生物學領域的研究意味著超越編碼信使RNA,這是中心法則的重點。揭示新型ncRNA的關鍵作用的追求引起了強烈的科學興趣,具有發現新的疾病調節劑,新的生物標志物和治療靶標的誘人機會。雖然基因表達分析行業仍主要僅涵蓋mRNA,但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進。 

焦點

除了傳統的mRNA表達分析之外,Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉錄組范圍分析,每個類具有不同的RNA特性和生物活性,需要更專業的方法和生物信息學來分析:

•lncRNAs 
•環狀RNAs 
•tRNAs 
•tRFs和tiRNAs 
•snoRNAs 
•microRNAs及其靶mRNA 
•piRNAs 

 

NuRNA™tRNA修飾酶PCR陣列(H)

Arraystar NuRNA™人類tRNA修飾酶PCR Array描述了參與tRNA修飾的85種關鍵酶和蛋白質因子的基因表達。Array是一種快速,方便和強大的工具,可用于探索和分析這些tRNA修飾因子,以便在形成,微調和調節tRNA功能(如蛋白質翻譯,代謝,應激反應和疾病)中發揮作用。

 

Product Name

Catalog No

Size

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

AS-NM-001-1

384 (4x96)-well plate

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NM-001-1-R

384 (4x96)-well plate

 

 

優點
•*內容 - 涵蓋UniProt和Modomics中的所有tRNA修飾酶
•嚴格 - 所有引物對和分析都經過精心優化和嚴格驗證 
•方便 - 易于使用的平板格式,可直接用于完整分析樣品。不需要樣品預擴增。

我們建議在運行NuRNA™tRNA修飾酶PCR陣列時使用我們的rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒  (AS-FS-001)ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix,以獲得*性能。

 

tRNA是蛋白質翻譯中用于解碼帶電荷氨基酸的遺傳密碼的關鍵組分。近的研究表明,tRNA以及它們衍生的小的非編碼RNApian段是動態調節的,具有非常規功能,如適應性翻譯,細胞增殖/分化,應激反應,代謝和疾病[1]。

tRNA在轉錄后經過大量修飾,具有多種化學修飾。這些修改對于整形,微調和調節tRNA功能的所有方面(如折疊,穩定性和解碼)至關重要。例如,莖環中的修飾對于tRNA結構和穩定性是至關重要的,在反密碼子環中用于翻譯準確性,在第34位用于密碼子 - 反密碼子擺動,并且在反密碼子環附近用于微調密碼子 - 反密碼子相互作用(圖1)。 )。 

 

圖1.人類tRNA修飾和tRNA修飾酶(括號中)。

這些化學修飾由tRNA修飾酶動態調節和催化[2]。tRNA修飾物的突變或失調與疾病有關,例如,具有小頭畸形的胞嘧啶-5 RNA甲基轉移酶(NSUN2)突變[3]和具有2型糖尿病的t6A甲基硫醇化酶[4]。疾病中tRNA修飾的新興重要性需要額外的工作[5,6]。如何通過tRNA修飾酶調節tRNA修飾是有必要進行研究的。

為了幫助研究人員快速方便地分析參與tRNA修飾的酶,Arraystar已經生產出個專門用于分析tRNA修飾酶的商業PCR板。該小組包含85種經過驗證或預測的tRNA修飾酶或蛋白質因子,這些酶來自研究出版物和數據庫,包括UniProt和Modomics。面板上的每個測定都在許多組織和細胞系中得到嚴格驗證。包括加標對照,陽性PCR對照,基因組DNA控制和標準化參考,以確保高的數據質量。

參考

[1] Kirchner S,Ignatova Z. tRNA在適應性翻譯,信號動態和疾病中的新興作用。自然評論Genetics 2015; 16:98-112。
[2] El Yacoubi B,Bailly M,de Crecy-Lagard V.生物合成和轉錄RNA轉錄后修飾的功能。遺傳學年度回顧2012; 46:69-95。
[3] Blanco S,Dietmann S,Flores JV,Hussain S,Kutter C,Humphreys P,et al。tRNA的異常甲基化將細胞應激與神經發育障礙聯系起來。EMBO期刊2014; 33:2020-39。
[4] Zhou B,Wei FY,Kanai N,Fujimura A,Kaitsuka T,Tomizawa K.通過人類編碼獨立機制調節2型糖尿病風險因子CDKAL1水平的剪接變體的鑒定。Human molecular genetics 2014; 23:4639-50。
[5] Zhang X,Cozen AE,Liu Y,Chen Q,Lowe TM。小RNA修飾:功能和疾病的整合。2016年分子醫學趨勢。
[6] Suzuki T,Nagao A,Suzuki T.人類線粒體tRNA:生物發生,功能,結構方面和疾病。遺傳學年度回顧2011; 45:299-329。

 

 

工作流程

 

 

兼容的qPCR儀器:

ABI ViiA™7 
ABI 7500和ABI 7500 FAST 
ABI 7900HT 
ABI QuantStudio™6 Flex實時PCR系統
ABI QuantStudio™7 Flex實時PCR系統
ABI QuantStudio™12K Flex實時PCR系統
Bio-Rad CFX384 
Bio-Rad iCycler &iQ實時PCR系統
Eppendorf Realplex 
QIAGEN轉子基因Q 100 
Roche Light Cycler 480 
Stratagene Mx3000 
Roche Light Cycler 480

 

 

 

 

 

Arraystar 2018年產品列表

 

貨號

品名

規格

品牌

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-004-1

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004-1-R

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004M-1

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-004M-1-R

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-001-1

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-001-1-R

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-002-1

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-002-1-R

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-003-1

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-003-1-R

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-004-1

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

384-well plate

arraystar

AS-NM-004-1-R

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well plate

arraystar

AS-NR-001H-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001H-1-R

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1-R

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-MB-001

Seq-Star™ rRNA Removal Kit

Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation

arraystar

AS-MB-006-01

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-006-02

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-007

Seq-Star™ DNAClean Beads

50mL

arraystar

AS-MB-008-01

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-008-02

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-010-01

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-010-02

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-012-01

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-012-02

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-013-01

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA)

24 reactions

arraystar

AS-MB-013-02

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB)

24 reactions

arraystar

AS-PACK-001-A

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-PACK-001-B

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-MR-005-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-005-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL

25mL

arraystar

AS-MR-006-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-006-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL

25mL

arraystar

AS-FS-001

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-002

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-003

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

6 reactions

arraystar

AS-FS-003-02

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-004

rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-002-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001M-1-M

rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-004-1-M

rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-002-1

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well(2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002-1-R

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1

nrStar™ Mouse tRF PCR Array

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1-R

nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-003-1

nrStar™ Human snoRNA PCR Array

384 well / plate

arraystar

AS-NR-003-1-R

nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 well / plate

arraystar

 

 

 

 

上海起發實驗試劑有限公司是實驗試劑一站式采購服務商

1:強大的進口輻射能力,血清、抗體、耗材、大部分限制進口品等。

2:產品種類齊全,經營超過700多個品牌,基本涵蓋所有生物實驗試劑耗材。

3:提供加急服務,貨品一般1-2周到貨。

4:富有競爭力的價格優勢,絕大部分價格有優勢。

5:多年積累良好的信譽,大部分客戶提供貨到付款服務。客戶包括清華、北大、交大、復旦、中山等100多所高校,ROCHE,阿斯利康、國藥、fisher等藥企。

6:我們還是Santa,Advanced Biotechnologies Inc,Athens Research & Technology,bangs,BBInternational,crystalchem,dianova,FD Neurotechnologies,Inc. FormuMax Scientific,Inc, Genebridege, Glycotope Biotechnology GmbH; iduron,Innovative Research of America, Ludger, neuroprobe,omicronbio, Polysciences,prospecbi, QA-BIO,quickzyme,RESEARCH DIETS,INC,sterlitech;sysy,TriLink BioTechnologies,Inc;worthington-biochem,zyagen等幾十家國外公司授權代理。

7:我們還是invitrogen,qiagen,MiraiBioam,sigma;neb,roche,merck, rnd,BD, GE,pierce,BioLegend等*批發,歡迎合作。

 

 

 

上海起發實驗試劑有限公司
地址:上海浦東川沙鎮川沙路6619號上海起發實驗試劑有限公司
郵箱:xs1@78bio.com
傳真:021-50724961
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