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血清/血漿游離 DNA(cfDNA) 提取試劑盒

更新時間:2017-09-01      點擊次數:15296

cfPure™血清/血漿游離  DNA(cfDNA) 提取試劑盒

(磁珠法)

 

目錄號:K5011610, K5011625

 

產品內容

產品號:K5011610(100ml 血清/血漿樣本提取試劑盒)

組分

產品號

規格

1.  裂解/結合液 Lysis/Binding Buffer

K5011610-1

1 x 115 ml

2.  洗滌液 Wash Buffer

K5011610-2

2 x 55 ml

3.  洗脫液 Elution Buffer

K5011610-3

1 x 6 ml

4.  磁珠溶液 Magnetic Bead Solution

K5011610-4

2 x 1.33 ml

產品號:K5011625(250ml 血清/血漿樣本提取試劑盒)

組分

產品號

規格

1.  裂解/結合液 Lysis/Binding Buffer

K5011625-1

3 x 95 ml

2.  洗滌液 Wash Buffer

K5011625-2

5 x 55 ml

3.  洗脫液 Elution Buffer

K5011625-3

1 x 15 ml

4.  磁珠溶液 Magnetic Bead Solution

K5011625-4

5 x 1.33 ml

 

儲存條件

該試劑盒置于室溫(15-25℃)干燥條件下,可保存 12 個月。

特點

l 無毒。

l 高回收率。

l 操作靈活的實驗程序。

l 純化的 DNA 可用于二代測序(NGS), 熒光定量 PCR 和亞硫酸氫鹽測序等。

產品簡介

本試劑盒可率從血清/血漿中提取游離 DNA,磁珠法程序適用于多種核酸自動化提取 儀,所得游離 DNA 可直接用于 PCR 模  板、qPCR、二代測序(NGS)和其他應用程序。 規格

100ml 血清/血漿樣本提取試劑盒

250ml 血清/血漿樣本提取試劑盒 質量控制 所有試劑均經過純度和有效性測試。

注意事項 請務必在使用本試劑盒之前閱讀此注意事項

樣本:新鮮和凍存血清/血漿均可使用,新鮮樣本會有較高的得率。

量化:每毫升血清/血漿游離 DNA 得率為 1-100 微克。用分光光度法定量(例如. Nanodrop)

可能無法準確地測定得率。可使用 Qubit™  dsDNA High Sensitivity Assay。

聚合酶鏈反應(PCR)的建議:由于血清/血漿中提取 DNA 多數為小片段特性,設計引物時需謹

慎。游離 DNA 往往為小片段 170bp 左右,因此,PCR 引物設計應該生成的產物為小于 150 bp

范圍。健康人血漿游離 DNA 濃度低,PCR 的循環次數在某些情況下需達到 40 個循環。

treck Cell-Free DNA BCT Tube(s) 基因檢測無創采血管:  無創管經蛋白酶 K 處理可分離高質

量的無細胞 DNA,否則 DNA 得率會減少 50%。

自備設備和試劑

l     移液管

l     渦流混合器

l     磁力架

l     1.5 ml 不黏離心管

l     無水乙醇

使用前:裂解/結合液 Lysis/Binding Buffer 及 Wash Buffer 洗滌液為濃縮液。若溶液發生 沉淀,放置 37°C 水浴中預熱 30 分鐘,以溶解沉淀。*次使用試劑盒時,請按照提示在裂 / Lysis/Binding Buffer 滌液 Wash Buffer 入無 2-8°C 年, 蓋緊瓶蓋以確保長期存儲。

產品號:K5011610

l    加入 23ml 無水乙醇至裂解/結合液 Lysis/Binding Buffer 中,輕輕顛倒混勻。

l     加入 51 ml 無水乙醇至每個洗滌液 Wash Buffer 中,輕輕顛倒混勻。

l     每次提取前配制新鮮 80%乙醇。

產品號:K5011625

l    加入 19ml 無水乙醇至每個裂解/結合液 Lysis/Binding Buffer 中,輕輕顛倒混勻。

l 加入 51 ml 無水乙醇至每個洗滌液 Wash Buffer 中,輕輕顛倒混勻。

l 每次提取前配制新鮮 80%乙醇。

實驗/漿量100µl~10ml  均可計算/

Lysis/Binding Buffer 和 Magnetic Bead Solution 磁珠溶液使用量。

 

血清/血漿

裂解/結合液

 

Lysis/Binding Buffer

磁珠溶液 Magnetic

 

Bead Solution

離心管尺寸

x (x=ml of 血清/血漿)

1.25x

0.025x

N/A

500 µl

750 µl

12.5 µl

2 ml

1 ml

1.25 ml

25 µl

15 ml

5 ml

6.25 ml

125 µl

15 ml or 或 50ml*

10 ml

12.50 ml

250 µl

50 ml

 

*5ml 或以上血清/血漿建議使用 50ml 離心管,使用 15ml 離心管造成泄露會造成得率降低。

蛋白酶 K 處理

如果樣品使用基因檢測無創采血管 Streck Cell-Free DNA BCT Tube(s)采集,蛋白酶 K 處理可

確保高回收率。非該采血管采集的樣本可直接進行裂解/結合 Lysis/Binding 步驟。

 

血清/血漿

蛋白酶 K

20% SDS 溶液

x (x=ml of 血清/血漿)

0.015 x

0.050 x

500 µl

7.5 µl

25 µl

1 ml

15 µl

50 µl

5 ml

75 µl

250 µl

10 ml

150 µl

500 µl

 

1. 加入適量血清/血漿到適合的離心管中。

2.  1ml /漿 15 µl 蛋白酶 K20 mg/ml

3. 每 1ml 血清/血漿加入 50 µl SDS(20%)溶液。

4. 顛倒混勻 5 次。

5. 60°C 孵育 20 分鐘。

6. 冰上預冷 5 分鐘,放置室溫。

7. 放置室溫后可進行裂解/結合 Lysis/Binding 第二步

裂解/結合 Lysis/Binding

1. 加入適量血清/血漿到適合離心管中。

2.  1ml 血清/血漿加入 1.25ml 裂解/結合液 Lysis/Binding Buffer

3. 每 1ml 血清/血漿加入 25µl 磁珠溶液 Magnetic Bead Solution。 注意:加入之前混勻磁珠溶液,確保溶液無磁珠沉淀。磁珠會迅速下沉所以每次加樣前都 要混勻磁珠,以免造成 DNA 得率不一致。

4. 室溫渦流混合或用力搖動離心管 10 分鐘。*為獲得高產量,確保血樣本/緩沖溶液在管內混 合,推薦使用旋渦混合器。

5. 將離心管置于磁力架磁分離 2~5 分鐘或直至溶液清透。

6. 保持離心管置于磁力架上小心去除上清,不要觸碰磁珠。

7. 保持離心管置于磁力架上 1 分鐘,去除殘液。

*次洗滌

8. 加入 1000µl 洗滌液 Wash Buffer 至第 7 步裂解/結合 Lysis/Binding 管中。 9. 渦流混合 10 秒或移液管吹打 6 次重懸磁珠。

10.  將重懸液移至 1.5ml 離心管置于磁力架。

11.  置于磁力架 10~30 秒。

12.  移液管抽取上清至裂解/結合 Lysis/Bindin 管。

13. 將裂解/結合 Lysis/Bindin 管中剩余磁珠全部移至 1.5ml 離心管。

14.  1.5ml 離心管置于磁力架磁分離 10~30 秒至液體清澈。

15.  用 1000µl 移液槍頭盡量去除上清。

16. 用裝有離心管的磁力架輕輕敲擊實驗臺 5 次,用 200µl 移液槍頭去除廢液。

17.  離心管移至試管架上加入 1000µl 洗滌液 Wash Buffer。

18.  渦流混合 20 秒或移液管吹打 6 次重懸磁珠。

19.  短暫離心。*離心僅用于渦流混合之重懸磁珠,短暫離心僅為去除離心管蓋上的吸附液體。

20.  離心管置于磁力架磁分離 10~30 秒。

21.  用 1000µl 移液槍頭盡量去除上清。

22. 用裝有離心管的磁力架輕輕敲擊實驗臺 5 次,用 200µl 移液槍頭去除廢液。

第二次洗滌

23.  離心上加 1000µl 醇(80%

24.  渦流混合 20 秒或移液管吹打 6 次重懸磁珠。

25. 短暫離心。

26.  離心管置于磁力架磁分離 10~30 秒至溶液清澈。

27.  用 1000µl 移液槍頭盡量去除上清。

28. 用裝有離心管的磁力架輕輕敲擊實驗臺 5 次,用 200µl 移液槍頭去除廢液。

29.  離心上加 1000µl 醇(80%

30. 渦流混合 20 秒或移液管吹打 6 次重懸磁珠。

31. 短暫離心。

32.  離心管置于磁力架磁分離 10~20 秒。

33.  用 1000µl 移液槍頭盡量去除上清并保持管蓋打開。

34.  用裝有離心管的磁力架輕輕敲擊實驗臺 5 次。

35.  用 200µl 移液槍頭去除廢液。

36. 保持管蓋打開 2 分鐘,磁力架輕輕敲擊實驗臺 5 次,用 200µl 移液槍頭去除廢液。

37.  繼續干燥 1-3 分鐘。*注意不要過分干燥以免磁珠粘在管壁上。

洗脫

38.  離心適量脫液 Elution Buffer注意血清/漿加入 12.5

µl 洗脫液 Elution Buffer 以確保*得率。 39.  渦流混合或用力搖動離心管 5 分鐘。

40. 短暫離心。

41.  置于磁力架 10~30 秒。

42.  上清移至新 1.5ml 離心管。

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